2009年国家重大疾病预防控制项目和中央补助地方公共卫生项目稳步推进。中央补助地方公共卫生专项资金疾病预防控制项目共10个，中央财政转移支付经费已达58亿元。在实施的第一年，这些项目赢得了“开门红”。在日前举行的2010年全国疾病预防控制暨爱国卫生工作会议上，卫生部部长陈竺报告了几个项目的具体实施进展。
--15岁以下人群补种乙肝疫苗项目首战告捷。项目工作已在全国所有省(区、市)启动，截至2009年12月底，各省(区、市)实际完成补种乙肝疫苗第一针已达2878.3万人，超过2009年度2300万人的计划目标。
--燃煤污染型氟中毒病区改炉改灶项目完成前期准备工作。贵州、云南、湖南等6个省份围绕87万户的改炉改灶任务，制订了项目实施方案，完成了项目资金划拨、人员培训和基线调查等工作，已进入具体落实阶段。
--农村改水改厕项目取得明显进展。28个省(区、市)启动项目，14个省(区、市)厕所建设进入实质性施工阶段，21个省(区、市)落实省级配套资金7.66亿元。2009年度农村改厕项目已完成33万户无害化卫生厕所建设。
--作为中央补助地方公卫项目之一，农村妇女“两癌”检查项目中的乳腺癌筛查已全面展开。截至2009年年底，实际筛查人数271187，任务完成率67.80%；确诊乳腺癌70例(其中早期癌17例)、良性肿瘤1306例、其他病变9819例。

    会上，在谈到过去一年疾控战线的硬仗--甲流防控时，陈竺十分动情地说：“在这场战斗中，我国疾控体系和医疗服务体系再次经受了洗礼，全体医疗卫生工作者经受住了考验!疾控战线的同志们夜以继日地忘我工作，用实际行动树立了公共卫生工作者崇高形象。目前甲流防控战斗仍在继续，并且有可能变得更加激烈，我深信，有这种顽强的精神、昂扬的斗志，我们一定能取得这场战斗的最后胜利!”